南京市實(shí)時熒光定量PCR儀研發(fā)
發(fā)布時間：2024-05-25 01:14:19
南京市實(shí)時熒光定量PCR儀研發(fā)
熱啟動PCR（hot start PCR）是指使Taq DNA 聚合酶只有在樣品溫度至少超過70℃時才發(fā)揮作用的PCR，可提高反應(yīng)的特異性。Taq DNA 聚合酶通常在比適宜溫度低得多的條件下仍有較強(qiáng)的活性。PCR 反應(yīng)的初加熱過程中，樣品溫度上升到70℃之前，在較低的溫度下引物可能與部分單鏈模板形成非特異性結(jié)合，并在Taq DNA 聚合酶的作用下延伸。結(jié)果會導(dǎo)致非靶序列的擴(kuò)增，影響反應(yīng)的特異性。熱啟動可減少非靶序列的擴(kuò)增，提高反應(yīng)的特異性。在引物設(shè)計時如果某位點(diǎn)因?yàn)檫z傳元件的定位而受限，如site-directed 突變、表達(dá)克隆或用于DNA 工程的遺傳元件的構(gòu)建和操作等情況，熱啟動PCR 尤為有效。
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在PCR反應(yīng)早期，產(chǎn)生熒光的水平不能與背景明顯地區(qū)別，而后熒光的產(chǎn)生進(jìn)入指數(shù)期、線性期和終的平臺期，因此可以在PCR反應(yīng)處于指數(shù)期的某一點(diǎn) 上來檢測PCR產(chǎn)物的量，并且由此來推斷模板初的含量。為了便于對所檢測樣本進(jìn)行比較，在real-time Q-PCR反應(yīng)的指數(shù)期，首先需設(shè)定一定熒光信號的域值，一般這個域值（threshold）是以PCR反應(yīng)的前15個循環(huán)的熒光信號作為熒光本底信號 （baseline），熒光域值的缺省設(shè)置是3～15個循環(huán)的熒光信號的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍。如果檢測到熒光信號超過域值被認(rèn)為是真 正的信號，它可用于定義 樣本的域值循環(huán)數(shù)（Ct）。Ct值的含義是：每個反應(yīng)管內(nèi)的熒光信號達(dá)到設(shè)定的域值時所經(jīng)歷的循環(huán)數(shù)。研究表明，每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的 對數(shù)存在線性關(guān)系，起始拷貝數(shù)越多，Ct值越小。利用已知起始拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品可作出標(biāo)準(zhǔn)曲線，因此只要獲得未知樣品的Ct值，即可從標(biāo)準(zhǔn)曲線上計算出該樣 品的起始拷貝數(shù)。
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常規(guī)普通PCR常見問題：1. 優(yōu)化反應(yīng)條件，梯度摸索退火溫度，延長退火延伸時間，增加反應(yīng)循環(huán)數(shù)（30-45區(qū)間為宜）。2. 對核酸模板進(jìn)行純化，或使用商業(yè)化核酸提取試劑盒進(jìn)行提取，增加核酸模板的上樣量。3. 優(yōu)化反應(yīng)體系（預(yù)混體系除外），改變檢測體系中的Mg2+濃度及dNTPs用量，更換體系中Buffer。4. 重新設(shè)計引物，避免引物二聚體和鏈內(nèi)二級結(jié)構(gòu)，在一次稀釋引物后可分裝成多支小管，減少反復(fù)凍融次數(shù)。
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傳染病流行過程的三:個基本環(huán)節(jié):①傳染源。即傳染來源，就是被感染的動物，包括傳染病病畜禽和帶菌(毒)動物，如潛伏期帶菌(毒)、病愈后帶菌(毒)及健康動物帶菌(毒)等。②傳播方式和途徑。有直接接觸傳播及間接接觸傳播。③易感動物。就是對某種傳染病的病原體有易感性的動物。
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化驗(yàn)室診斷方法采用的檢測依據(jù)有以下幾種:①國家標(biāo)準(zhǔn)以及農(nóng)業(yè)標(biāo)準(zhǔn);②動物疫病檢測的其他規(guī)范:③化驗(yàn)室自行設(shè)定的檢測方法。不管采用何種方法，都需要考慮化驗(yàn)室自身的條件及樣品類型，如在對偽狂犬病進(jìn)行診斷時，實(shí)驗(yàn)室有酶標(biāo)儀，沒有基因擴(kuò)增儀，在診斷時檢測人員可采用酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)進(jìn)行診斷。如果送檢樣品為血清，檢測人員則可以采用酶聯(lián)吸附試驗(yàn)，而不需要采用動物接種試驗(yàn)與病毒分離鑒定方法。
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強(qiáng)化監(jiān)督檢查。中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所要加強(qiáng)疫苗質(zhì)量監(jiān)管工作，開展監(jiān)督抽檢，對生產(chǎn)企業(yè)實(shí)行督導(dǎo)檢查。各級農(nóng)業(yè)農(nóng)村部門要加強(qiáng)對轄區(qū)內(nèi)強(qiáng)制免疫疫苗生產(chǎn)企業(yè)的監(jiān)督檢查，督促生產(chǎn)企業(yè)嚴(yán)格執(zhí)行獸藥生產(chǎn)質(zhì)量管理規(guī)范（GMP）。實(shí)施獸藥“二維碼”管理制度，加強(qiáng)疫苗追蹤和全程質(zhì)量監(jiān)管，嚴(yán)厲打擊制售假劣疫苗行為。對拒不履行強(qiáng)制免疫義務(wù)、因免疫不到位引發(fā)動物疫情的單位和個人，要依法處理并追究責(zé)任。